Огромную роль в историческом и человеческом плане станицы сыграла Великая Отечественная война 1941-1945 г.г. В первый год войны отсюда на фронт ушли 1318 человек, а в 1942 году враг оккупировал Змейскую, но станичники не сдавались и оказывали отчаянное сопротивление. Был организован и действовал партизанский отряд. В январе 1943 года станица была очищена от фашистов.
С полей Великой Отечественной не вернулось 640 человек. Фамилии Липовых и Синяковских потеряли по 14 человек, Черновых — 11 человек, Кравченко — 10 человек, Бондарь — 9, Лепехиных, Колесник — 7 человек и т.д.
В годы Великой Отечественной войны из села на различные фронты были призваны и ушли добровольцами около 500 человек. Каждый второй из них не вернулся в родную семью, а именно 267 человек. Те, кто вернулись, были с тяжелыми ранениями.